La designación de Fernando Pareja como nuevo vicefiscal general de la Nación por parte del fiscal general encargado, Guillermo Mendoza, ha causado revuelo en el sector judicial. Algunos funcionarios de la institución protestaron porque hubiera sido nombrada una persona externa. Esto produjo entre otras cosas que el director de la Unidad de fiscales ante la Corte Suprema de Justicia, Omar Zarabanda, quien se consideraba el candidato natural para el cargo, renunciara. En la Casa de Nariño este nombramiento ha sido interpretado como un gesto de Mendoza hacia la Corte, ya que Pareja es cercano a ese organismo por ser magistrado del Tribunal Superior de Bogotá, al que llegó por concurso con el segundo mejor puntaje del país. La Corte es la que decidirá finalmente cuánto tiempo permanecerá Mendoza a la cabeza de la Fiscalía ante el impasse de la terna enviada por el Presidente.