El anuncio de la secretaria de salud de Bogotá de reabrir el hospital San Juan de Dios, desato una fuerte polémica entre el distrito y la gobernación de Cundinamarca. Hace dos meses, el distrito tomo posesión de las instalaciones, en la esquina del norte del complejo hospitalario y anuncio inversiones por 7.000 millones para rehabilitar y dotar al centro                                                              

 beneficencia de Cundinamarca, propietaria del complejo, sino un gerente liquidador nombrado desde el 2006, en cumplimiento de una sentencia (484 del 2005), que regula la liquidación del San Juan De Dios  La secretaria de salud aseguro que el dueño del centro de salud por un comodato a 99 años mediante el cual beneficia lo entrego a la ciudad.