Su paso por el Congreso se dio entre 2002 y 2006 cuando fue elegido como senador, por elección popular, por el partido Liberal.
Al igual que en el periodismo, Artunduaga, pisó muchos callos en el Congreso. Uno de los casos más recordados fue cuando denunció que en el Congreso se consumía droga. Dijo, en ese momento que "en el Congreso colombiano se vendían drogas y que algunos de los congresistas eran consumidores habituales de estos productos"
Esta denuncia, en donde mencionó a Armando Benedetti como uno de los sospechosos de ese consumo, le conllevó una demanda por injuria y calumnia. El senador Benedetti le pidió que presentara pruebas concretas de sus afirmaciones, de lo contrario, que renunciara a su cargo de senador de la República.Así lo reseñó el diario El Tiempo.
Artunduaga no presentó pruebas y solo dijo que Benedetti era uno de los sospechosos. Ante esta situación, este legislador presentó una demanda por injuria y calumnia.
Iniciativas:
En el archivo del Congreso aparecen varias iniciativas a su nombre o compartidas, algunas de ellas:
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Por la cual se dictan normas para el cobro de tarifas de la telefonia fija y celulares y se establecen otras disposiciones
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Por la cual se declara Bogotá D.C, "territorio de paz" se promueve la cultura por la vida y se dictan otras disposiciones"
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Por medio del cual se regula la publicación de las encuestas
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Por medio de la cual se reconoce la profesión de periodista.
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Por la cual se dispone la creación de mecanismo para el otorgamiento de cupos para el ingreso a la educación superior, de estudiantes de escasos recursos económicos provenientes de lugares con deficiencias en la prestación del servicio educativos